Confederazione
L'Ufficio federale dell'ambiente (UFAM) è l'autorità federale svizzera competente in materia ambientale e responsabile, tra l'altro, della protezione della biodiversità e della conservazione delle specie autoctone, tra cui figurano anche il lupo, l'orso e la lince. Nel settore della protezione del bestiame, l'UFAM svolge un ruolo di coordinamento, finanziamento e definizione delle linee guida. In concreto, l'UFAM promuove e coordina le misure cantonali volte a prevenire i danni causati dalla selvaggina ed è responsabile dell'esame nazionale di idoneità per i cani da protezione delle greggi. Può ricorrere a terzi per l'attuazione della protezione delle greggi. La Centrale di consulenza agricola AGRIDEA è incaricata dall'UFAM, in collaborazione con il Servizio per la prevenzione degli infortuni in agricoltura (BUL), di svolgere compiti nell'ambito dell'esame di idoneità e di coordinamento.
L'Ufficio federale dell'agricoltura (UFAG), in qualità di autorità specializzata della Confederazione, provvede all'attuazione della legislazione federale in materia di agricoltura. In questo contesto, garantisce il compenso per le prestazioni di interesse pubblico fornite dalle aziende agricole, come ad esempio la cura del paesaggio rurale o la garanzia del benessere degli animali. Mediante pagamenti diretti, l'UFAG promuove misure agricole quali, ad esempio, la sorveglianza permanente delle pecore durante l'estivazione e, tramite un cosiddetto contributo supplementare, l'attuazione di misure di protezione delle greggi a livello di singola azienda nelle aziende di estivazione e nei pascoli comunitari.
L'Ufficio federale della sicurezza alimentare e di veterinaria (USAV), in qualità di autorità specializzata della Confederazione, garantisce l'applicazione della legislazione federale sulla protezione degli animali, che comprende anche le norme relative al trattamento dei cani e alle responsabilità dei loro detentori. I cani da protezione delle greggi sono menzionati esplicitamente più volte nella legislazione sulla protezione degli animali.